Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN1BP46527 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN1BP46527 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN1BP46527 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN1BP46527 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN1BP46527 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN1BP46527 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN1BP46527 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN1BP46527 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN1BP46527 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN1BP46527 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN1BP46527 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN1BP46527 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN1BP46527 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1BP46527 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN1BP46527 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDKN1BP46527 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN1BP46527 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN1BP46527 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN1BP46527 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN1BP46527 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN1BP46527 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN1BP46527 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN1BP46527 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN1BP46527 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN1BP46527 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN1BP46527 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN1BP46527 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN1BP46527 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN1BP46527 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN1BP46527 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN1BP46527 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKN1BP46527 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKN1BP46527 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKN1BP46527 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN1BP46527 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKN1BP46527 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN1BP46527 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKN1BP46527 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKN1BP46527 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN1BP46527 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN1BP46527 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKN1BP46527 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKN1BP46527 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDKN1BP46527 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDKN1BP46527 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms