Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATRXP46100 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATRXP46100 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATRXP46100 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATRXP46100 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATRXP46100 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRXP46100 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRXP46100 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATRXP46100 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATRXP46100 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATRXP46100 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATRXP46100 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATRXP46100 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATRXP46100 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRXP46100 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRXP46100 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRXP46100 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATRXP46100 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATRXP46100 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ATRXP46100 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRXP46100 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATRXP46100 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATRXP46100 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRXP46100 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRXP46100 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATRXP46100 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATRXP46100 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATRXP46100 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATRXP46100 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATRXP46100 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATRXP46100 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATRXP46100 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATRXP46100 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATRXP46100 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATRXP46100 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATRXP46100 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATRXP46100 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATRXP46100 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATRXP46100 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATRXP46100 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATRXP46100 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATRXP46100 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRXP46100 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATRXP46100 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATRXP46100 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATRXP46100 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRXP46100 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATRXP46100 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRXP46100 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRXP46100 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRXP46100 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRXP46100 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATRXP46100 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRXP46100 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRXP46100 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRXP46100 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRXP46100 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRXP46100 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATRXP46100 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATRXP46100 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATRXP46100 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATRXP46100 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRXP46100 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRXP46100 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATRXP46100 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATRXP46100 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATRXP46100 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATRXP46100 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATRXP46100 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRXP46100 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRXP46100 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRXP46100 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRXP46100 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRXP46100 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRXP46100 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRXP46100 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRXP46100 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRXP46100 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRXP46100 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRXP46100 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRXP46100 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRXP46100 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRXP46100 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRXP46100 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRXP46100 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRXP46100 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRXP46100 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRXP46100 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATRXP46100 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ATRXP46100 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRXP46100 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRXP46100 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRXP46100 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRXP46100 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRXP46100 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRXP46100 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRXP46100 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRXP46100 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATRXP46100 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATRXP46100 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms