Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MKI67P46013 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
MKI67P46013 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
MKI67P46013 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MKI67P46013 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
MKI67P46013 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MKI67P46013 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
MKI67P46013 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MKI67P46013 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MKI67P46013 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MKI67P46013 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
MKI67P46013 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MKI67P46013 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MKI67P46013 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MKI67P46013 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MKI67P46013 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MKI67P46013 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKI67P46013 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKI67P46013 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MKI67P46013 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MKI67P46013 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MKI67P46013 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MKI67P46013 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MKI67P46013 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MKI67P46013 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MKI67P46013 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MKI67P46013 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MKI67P46013 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MKI67P46013 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MKI67P46013 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MKI67P46013 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MKI67P46013 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MKI67P46013 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MKI67P46013 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MKI67P46013 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MKI67P46013 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MKI67P46013 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MKI67P46013 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MKI67P46013 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MKI67P46013 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MKI67P46013 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MKI67P46013 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
MKI67P46013 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MKI67P46013 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MKI67P46013 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MKI67P46013 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MKI67P46013 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MKI67P46013 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MKI67P46013 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MKI67P46013 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MKI67P46013 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MKI67P46013 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MKI67P46013 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
MKI67P46013 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MKI67P46013 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MKI67P46013 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MKI67P46013 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
MKI67P46013 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MKI67P46013 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MKI67P46013 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MKI67P46013 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
MKI67P46013 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MKI67P46013 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
MKI67P46013 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MKI67P46013 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MKI67P46013 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MKI67P46013 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MKI67P46013 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MKI67P46013 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MKI67P46013 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MKI67P46013 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MKI67P46013 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
MKI67P46013 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MKI67P46013 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MKI67P46013 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MKI67P46013 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MKI67P46013 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MKI67P46013 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MKI67P46013 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
MKI67P46013 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MKI67P46013 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MKI67P46013 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MKI67P46013 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MKI67P46013 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
MKI67P46013 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MKI67P46013 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MKI67P46013 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MKI67P46013 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MKI67P46013 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MKI67P46013 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
MKI67P46013 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MKI67P46013 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MKI67P46013 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MKI67P46013 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MKI67P46013 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MKI67P46013 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MKI67P46013 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
MKI67P46013 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
MKI67P46013 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MKI67P46013 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms