Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RANBP1P43487 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RANBP1P43487 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RANBP1P43487 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RANBP1P43487 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RANBP1P43487 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RANBP1P43487 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RANBP1P43487 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RANBP1P43487 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RANBP1P43487 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANBP1P43487 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RANBP1P43487 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANBP1P43487 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RANBP1P43487 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANBP1P43487 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANBP1P43487 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANBP1P43487 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RANBP1P43487 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANBP1P43487 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANBP1P43487 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANBP1P43487 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANBP1P43487 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANBP1P43487 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANBP1P43487 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RANBP1P43487 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RANBP1P43487 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RANBP1P43487 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RANBP1P43487 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RANBP1P43487 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RANBP1P43487 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANBP1P43487 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RANBP1P43487 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms