Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX19P40855 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX19P40855 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PEX19P40855 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PEX19P40855 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX19P40855 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX19P40855 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX19P40855 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX19P40855 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PEX19P40855 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PEX19P40855 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PEX19P40855 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PEX19P40855 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX19P40855 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX19P40855 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX19P40855 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX19P40855 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PEX19P40855 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PEX19P40855 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PEX19P40855 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PEX19P40855 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX19P40855 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX19P40855 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PEX19P40855 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX19P40855 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX19P40855 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX19P40855 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX19P40855 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX19P40855 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX19P40855 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX19P40855 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX19P40855 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PEX19P40855 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX19P40855 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX19P40855 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX19P40855 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX19P40855 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX19P40855 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX19P40855 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX19P40855 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX19P40855 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX19P40855 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX19P40855 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX19P40855 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX19P40855 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX19P40855 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX19P40855 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX19P40855 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX19P40855 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX19P40855 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX19P40855 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX19P40855 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX19P40855 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX19P40855 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX19P40855 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX19P40855 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX19P40855 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX19P40855 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX19P40855 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX19P40855 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX19P40855 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX19P40855 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX19P40855 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX19P40855 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX19P40855 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX19P40855 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX19P40855 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX19P40855 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX19P40855 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX19P40855 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX19P40855 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX19P40855 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX19P40855 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX19P40855 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX19P40855 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX19P40855 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX19P40855 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX19P40855 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX19P40855 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX19P40855 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX19P40855 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX19P40855 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX19P40855 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX19P40855 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PEX19P40855 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX19P40855 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX19P40855 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX19P40855 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX19P40855 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX19P40855 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX19P40855 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX19P40855 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX19P40855 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX19P40855 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX19P40855 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX19P40855 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX19P40855 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX19P40855 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX19P40855 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX19P40855 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms