Protein–RNA interactions for Protein: P36969

GPX4, Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPX4P36969 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPX4P36969 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPX4P36969 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPX4P36969 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPX4P36969 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPX4P36969 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPX4P36969 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPX4P36969 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPX4P36969 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPX4P36969 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPX4P36969 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPX4P36969 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPX4P36969 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPX4P36969 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPX4P36969 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPX4P36969 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPX4P36969 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPX4P36969 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPX4P36969 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPX4P36969 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPX4P36969 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPX4P36969 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPX4P36969 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPX4P36969 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPX4P36969 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPX4P36969 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPX4P36969 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPX4P36969 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPX4P36969 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPX4P36969 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPX4P36969 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPX4P36969 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPX4P36969 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPX4P36969 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPX4P36969 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPX4P36969 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPX4P36969 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPX4P36969 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPX4P36969 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPX4P36969 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPX4P36969 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPX4P36969 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPX4P36969 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPX4P36969 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPX4P36969 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPX4P36969 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPX4P36969 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPX4P36969 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPX4P36969 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPX4P36969 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPX4P36969 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPX4P36969 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPX4P36969 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPX4P36969 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPX4P36969 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPX4P36969 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPX4P36969 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPX4P36969 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPX4P36969 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPX4P36969 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPX4P36969 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPX4P36969 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPX4P36969 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPX4P36969 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPX4P36969 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPX4P36969 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPX4P36969 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPX4P36969 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPX4P36969 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPX4P36969 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPX4P36969 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPX4P36969 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPX4P36969 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPX4P36969 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPX4P36969 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPX4P36969 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPX4P36969 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPX4P36969 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPX4P36969 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPX4P36969 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPX4P36969 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPX4P36969 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPX4P36969 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPX4P36969 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPX4P36969 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPX4P36969 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPX4P36969 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPX4P36969 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPX4P36969 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPX4P36969 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPX4P36969 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPX4P36969 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPX4P36969 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPX4P36969 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPX4P36969 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPX4P36969 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPX4P36969 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPX4P36969 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPX4P36969 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPX4P36969 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms