Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGFBR1P36897 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFBR1P36897 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFBR1P36897 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFBR1P36897 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFBR1P36897 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFBR1P36897 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TGFBR1P36897 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFBR1P36897 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFBR1P36897 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFBR1P36897 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFBR1P36897 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFBR1P36897 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFBR1P36897 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFBR1P36897 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFBR1P36897 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TGFBR1P36897 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFBR1P36897 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFBR1P36897 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFBR1P36897 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFBR1P36897 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFBR1P36897 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFBR1P36897 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFBR1P36897 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFBR1P36897 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFBR1P36897 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFBR1P36897 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFBR1P36897 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFBR1P36897 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGFBR1P36897 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TGFBR1P36897 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFBR1P36897 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFBR1P36897 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGFBR1P36897 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFBR1P36897 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGFBR1P36897 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFBR1P36897 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGFBR1P36897 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGFBR1P36897 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGFBR1P36897 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGFBR1P36897 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGFBR1P36897 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGFBR1P36897 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGFBR1P36897 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFBR1P36897 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFBR1P36897 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGFBR1P36897 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGFBR1P36897 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGFBR1P36897 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFBR1P36897 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGFBR1P36897 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFBR1P36897 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFBR1P36897 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGFBR1P36897 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFBR1P36897 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFBR1P36897 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGFBR1P36897 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFBR1P36897 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFBR1P36897 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFBR1P36897 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFBR1P36897 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFBR1P36897 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFBR1P36897 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFBR1P36897 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFBR1P36897 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms