Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACTN2P35609 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ACTN2P35609 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACTN2P35609 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACTN2P35609 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ACTN2P35609 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ACTN2P35609 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ACTN2P35609 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN2P35609 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN2P35609 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ACTN2P35609 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ACTN2P35609 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ACTN2P35609 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACTN2P35609 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACTN2P35609 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN2P35609 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ACTN2P35609 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ACTN2P35609 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ACTN2P35609 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ACTN2P35609 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN2P35609 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN2P35609 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN2P35609 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ACTN2P35609 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ACTN2P35609 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ACTN2P35609 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ACTN2P35609 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ACTN2P35609 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ACTN2P35609 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ACTN2P35609 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ACTN2P35609 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ACTN2P35609 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN2P35609 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ACTN2P35609 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ACTN2P35609 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACTN2P35609 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN2P35609 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN2P35609 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN2P35609 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTN2P35609 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTN2P35609 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN2P35609 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACTN2P35609 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ACTN2P35609 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ACTN2P35609 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ACTN2P35609 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ACTN2P35609 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACTN2P35609 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ACTN2P35609 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ACTN2P35609 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ACTN2P35609 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ACTN2P35609 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTN2P35609 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTN2P35609 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTN2P35609 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACTN2P35609 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACTN2P35609 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ACTN2P35609 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ACTN2P35609 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN2P35609 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTN2P35609 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ACTN2P35609 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ACTN2P35609 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ACTN2P35609 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ACTN2P35609 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTN2P35609 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ACTN2P35609 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACTN2P35609 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACTN2P35609 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTN2P35609 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACTN2P35609 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTN2P35609 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTN2P35609 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTN2P35609 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ACTN2P35609 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ACTN2P35609 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms