Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERP29P30040 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERP29P30040 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERP29P30040 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERP29P30040 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERP29P30040 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERP29P30040 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERP29P30040 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERP29P30040 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERP29P30040 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERP29P30040 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERP29P30040 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERP29P30040 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERP29P30040 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERP29P30040 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERP29P30040 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERP29P30040 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERP29P30040 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERP29P30040 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERP29P30040 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERP29P30040 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERP29P30040 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERP29P30040 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERP29P30040 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERP29P30040 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERP29P30040 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP29P30040 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP29P30040 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERP29P30040 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERP29P30040 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERP29P30040 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERP29P30040 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERP29P30040 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERP29P30040 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERP29P30040 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERP29P30040 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERP29P30040 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERP29P30040 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERP29P30040 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERP29P30040 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERP29P30040 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP29P30040 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP29P30040 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP29P30040 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERP29P30040 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERP29P30040 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP29P30040 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERP29P30040 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERP29P30040 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERP29P30040 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERP29P30040 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERP29P30040 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP29P30040 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERP29P30040 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERP29P30040 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERP29P30040 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP29P30040 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERP29P30040 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP29P30040 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERP29P30040 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERP29P30040 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP29P30040 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP29P30040 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERP29P30040 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERP29P30040 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERP29P30040 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERP29P30040 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP29P30040 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP29P30040 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP29P30040 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP29P30040 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERP29P30040 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP29P30040 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP29P30040 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERP29P30040 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERP29P30040 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP29P30040 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP29P30040 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP29P30040 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP29P30040 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP29P30040 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP29P30040 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP29P30040 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP29P30040 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP29P30040 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERP29P30040 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERP29P30040 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP29P30040 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP29P30040 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP29P30040 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP29P30040 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP29P30040 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP29P30040 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERP29P30040 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERP29P30040 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP29P30040 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERP29P30040 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERP29P30040 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP29P30040 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERP29P30040 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms