Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB6P28072 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB6P28072 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB6P28072 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB6P28072 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB6P28072 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB6P28072 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB6P28072 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB6P28072 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB6P28072 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB6P28072 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB6P28072 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB6P28072 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB6P28072 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB6P28072 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB6P28072 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB6P28072 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB6P28072 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB6P28072 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB6P28072 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB6P28072 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB6P28072 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB6P28072 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB6P28072 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB6P28072 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB6P28072 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB6P28072 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB6P28072 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB6P28072 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB6P28072 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB6P28072 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB6P28072 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB6P28072 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB6P28072 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB6P28072 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB6P28072 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB6P28072 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB6P28072 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB6P28072 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB6P28072 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB6P28072 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB6P28072 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB6P28072 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB6P28072 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB6P28072 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB6P28072 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB6P28072 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB6P28072 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB6P28072 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB6P28072 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB6P28072 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB6P28072 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB6P28072 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms