Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGA6P23229 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ITGA6P23229 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ITGA6P23229 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGA6P23229 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGA6P23229 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ITGA6P23229 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGA6P23229 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ITGA6P23229 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGA6P23229 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGA6P23229 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITGA6P23229 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITGA6P23229 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITGA6P23229 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ITGA6P23229 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ITGA6P23229 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ITGA6P23229 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ITGA6P23229 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ITGA6P23229 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ITGA6P23229 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ITGA6P23229 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGA6P23229 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ITGA6P23229 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ITGA6P23229 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ITGA6P23229 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ITGA6P23229 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITGA6P23229 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITGA6P23229 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGA6P23229 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITGA6P23229 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ITGA6P23229 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ITGA6P23229 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITGA6P23229 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITGA6P23229 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGA6P23229 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGA6P23229 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITGA6P23229 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGA6P23229 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ITGA6P23229 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITGA6P23229 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITGA6P23229 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ITGA6P23229 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITGA6P23229 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ITGA6P23229 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ITGA6P23229 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ITGA6P23229 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ITGA6P23229 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ITGA6P23229 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITGA6P23229 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ITGA6P23229 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ITGA6P23229 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ITGA6P23229 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGA6P23229 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ITGA6P23229 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ITGA6P23229 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ITGA6P23229 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGA6P23229 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ITGA6P23229 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGA6P23229 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGA6P23229 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITGA6P23229 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGA6P23229 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGA6P23229 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGA6P23229 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ITGA6P23229 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ITGA6P23229 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGA6P23229 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGA6P23229 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGA6P23229 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ITGA6P23229 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGA6P23229 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGA6P23229 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGA6P23229 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGA6P23229 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGA6P23229 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms