Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTGS1P23219 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTGS1P23219 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTGS1P23219 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTGS1P23219 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTGS1P23219 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PTGS1P23219 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTGS1P23219 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTGS1P23219 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTGS1P23219 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTGS1P23219 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTGS1P23219 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTGS1P23219 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTGS1P23219 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTGS1P23219 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTGS1P23219 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTGS1P23219 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTGS1P23219 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTGS1P23219 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTGS1P23219 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PTGS1P23219 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTGS1P23219 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTGS1P23219 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTGS1P23219 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTGS1P23219 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTGS1P23219 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTGS1P23219 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTGS1P23219 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PTGS1P23219 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTGS1P23219 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTGS1P23219 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTGS1P23219 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTGS1P23219 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTGS1P23219 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTGS1P23219 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTGS1P23219 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTGS1P23219 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTGS1P23219 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTGS1P23219 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTGS1P23219 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTGS1P23219 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTGS1P23219 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTGS1P23219 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTGS1P23219 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTGS1P23219 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTGS1P23219 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTGS1P23219 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTGS1P23219 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTGS1P23219 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTGS1P23219 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTGS1P23219 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTGS1P23219 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTGS1P23219 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTGS1P23219 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTGS1P23219 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTGS1P23219 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTGS1P23219 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTGS1P23219 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTGS1P23219 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTGS1P23219 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTGS1P23219 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTGS1P23219 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTGS1P23219 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTGS1P23219 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTGS1P23219 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTGS1P23219 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTGS1P23219 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTGS1P23219 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTGS1P23219 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTGS1P23219 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTGS1P23219 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTGS1P23219 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTGS1P23219 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTGS1P23219 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTGS1P23219 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTGS1P23219 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTGS1P23219 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTGS1P23219 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTGS1P23219 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTGS1P23219 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTGS1P23219 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTGS1P23219 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTGS1P23219 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTGS1P23219 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTGS1P23219 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTGS1P23219 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PTGS1P23219 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTGS1P23219 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms