Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCMT1P22061 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCMT1P22061 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMT1P22061 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMT1P22061 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMT1P22061 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMT1P22061 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMT1P22061 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMT1P22061 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMT1P22061 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMT1P22061 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMT1P22061 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCMT1P22061 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMT1P22061 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMT1P22061 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMT1P22061 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMT1P22061 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMT1P22061 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMT1P22061 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCMT1P22061 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCMT1P22061 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCMT1P22061 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCMT1P22061 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMT1P22061 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCMT1P22061 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCMT1P22061 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMT1P22061 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMT1P22061 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMT1P22061 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCMT1P22061 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMT1P22061 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMT1P22061 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMT1P22061 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMT1P22061 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMT1P22061 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMT1P22061 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMT1P22061 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMT1P22061 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCMT1P22061 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCMT1P22061 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMT1P22061 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCMT1P22061 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCMT1P22061 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMT1P22061 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCMT1P22061 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCMT1P22061 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCMT1P22061 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCMT1P22061 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMT1P22061 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMT1P22061 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCMT1P22061 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCMT1P22061 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCMT1P22061 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMT1P22061 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms