Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA5P20719 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA5P20719 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA5P20719 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA5P20719 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA5P20719 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA5P20719 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA5P20719 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA5P20719 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA5P20719 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA5P20719 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA5P20719 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA5P20719 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA5P20719 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA5P20719 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA5P20719 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA5P20719 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA5P20719 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA5P20719 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA5P20719 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA5P20719 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA5P20719 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA5P20719 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA5P20719 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA5P20719 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA5P20719 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA5P20719 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA5P20719 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA5P20719 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA5P20719 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA5P20719 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA5P20719 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA5P20719 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA5P20719 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA5P20719 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA5P20719 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA5P20719 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA5P20719 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA5P20719 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA5P20719 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA5P20719 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA5P20719 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA5P20719 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA5P20719 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA5P20719 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA5P20719 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA5P20719 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA5P20719 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA5P20719 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA5P20719 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA5P20719 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA5P20719 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA5P20719 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms