Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM21P19474 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM21P19474 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM21P19474 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM21P19474 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM21P19474 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRIM21P19474 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TRIM21P19474 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM21P19474 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRIM21P19474 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRIM21P19474 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRIM21P19474 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRIM21P19474 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRIM21P19474 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRIM21P19474 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM21P19474 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRIM21P19474 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TRIM21P19474 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRIM21P19474 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRIM21P19474 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRIM21P19474 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRIM21P19474 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRIM21P19474 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRIM21P19474 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRIM21P19474 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRIM21P19474 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRIM21P19474 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRIM21P19474 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRIM21P19474 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM21P19474 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRIM21P19474 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRIM21P19474 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRIM21P19474 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRIM21P19474 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRIM21P19474 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRIM21P19474 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM21P19474 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRIM21P19474 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRIM21P19474 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM21P19474 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM21P19474 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM21P19474 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM21P19474 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM21P19474 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRIM21P19474 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRIM21P19474 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRIM21P19474 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRIM21P19474 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM21P19474 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM21P19474 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRIM21P19474 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM21P19474 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM21P19474 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM21P19474 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM21P19474 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM21P19474 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM21P19474 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM21P19474 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM21P19474 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM21P19474 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM21P19474 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM21P19474 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM21P19474 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM21P19474 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM21P19474 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM21P19474 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM21P19474 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms