Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI3P19429 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3P19429 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3P19429 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI3P19429 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3P19429 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI3P19429 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3P19429 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3P19429 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI3P19429 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI3P19429 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI3P19429 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI3P19429 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNI3P19429 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNI3P19429 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNI3P19429 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3P19429 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNI3P19429 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3P19429 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNI3P19429 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNI3P19429 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3P19429 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNI3P19429 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNI3P19429 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNI3P19429 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3P19429 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNI3P19429 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNI3P19429 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3P19429 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3P19429 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3P19429 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNI3P19429 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNI3P19429 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNI3P19429 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI3P19429 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI3P19429 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3P19429 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI3P19429 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3P19429 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI3P19429 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI3P19429 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI3P19429 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3P19429 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3P19429 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3P19429 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI3P19429 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI3P19429 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI3P19429 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI3P19429 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI3P19429 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI3P19429 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI3P19429 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI3P19429 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI3P19429 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI3P19429 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI3P19429 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3P19429 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3P19429 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3P19429 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3P19429 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3P19429 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNI3P19429 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3P19429 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3P19429 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3P19429 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3P19429 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3P19429 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI3P19429 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3P19429 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3P19429 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3P19429 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3P19429 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3P19429 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms