Protein–RNA interactions for Protein: P15313

ATP6V1B1, V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B1P15313 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1B1P15313 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V1B1P15313 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V1B1P15313 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V1B1P15313 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V1B1P15313 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP6V1B1P15313 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP6V1B1P15313 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP6V1B1P15313 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP6V1B1P15313 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP6V1B1P15313 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP6V1B1P15313 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP6V1B1P15313 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP6V1B1P15313 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP6V1B1P15313 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP6V1B1P15313 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP6V1B1P15313 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP6V1B1P15313 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP6V1B1P15313 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP6V1B1P15313 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP6V1B1P15313 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP6V1B1P15313 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP6V1B1P15313 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP6V1B1P15313 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP6V1B1P15313 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP6V1B1P15313 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP6V1B1P15313 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP6V1B1P15313 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP6V1B1P15313 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP6V1B1P15313 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1B1P15313 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1B1P15313 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1B1P15313 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP6V1B1P15313 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP6V1B1P15313 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP6V1B1P15313 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1B1P15313 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1B1P15313 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1B1P15313 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP6V1B1P15313 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP6V1B1P15313 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP6V1B1P15313 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP6V1B1P15313 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP6V1B1P15313 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP6V1B1P15313 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP6V1B1P15313 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP6V1B1P15313 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP6V1B1P15313 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP6V1B1P15313 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP6V1B1P15313 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1B1P15313 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP6V1B1P15313 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1B1P15313 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1B1P15313 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP6V1B1P15313 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP6V1B1P15313 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP6V1B1P15313 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1B1P15313 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1B1P15313 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1B1P15313 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1B1P15313 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1B1P15313 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1B1P15313 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1B1P15313 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1B1P15313 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1B1P15313 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1B1P15313 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V1B1P15313 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms