Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRKCSHP14314 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRKCSHP14314 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRKCSHP14314 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRKCSHP14314 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRKCSHP14314 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRKCSHP14314 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRKCSHP14314 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRKCSHP14314 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRKCSHP14314 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRKCSHP14314 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRKCSHP14314 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRKCSHP14314 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRKCSHP14314 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRKCSHP14314 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRKCSHP14314 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRKCSHP14314 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRKCSHP14314 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRKCSHP14314 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRKCSHP14314 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKCSHP14314 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRKCSHP14314 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKCSHP14314 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRKCSHP14314 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRKCSHP14314 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRKCSHP14314 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRKCSHP14314 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRKCSHP14314 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRKCSHP14314 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRKCSHP14314 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRKCSHP14314 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRKCSHP14314 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRKCSHP14314 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRKCSHP14314 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRKCSHP14314 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRKCSHP14314 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRKCSHP14314 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRKCSHP14314 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRKCSHP14314 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PRKCSHP14314 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRKCSHP14314 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRKCSHP14314 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRKCSHP14314 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRKCSHP14314 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRKCSHP14314 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRKCSHP14314 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRKCSHP14314 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRKCSHP14314 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRKCSHP14314 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRKCSHP14314 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRKCSHP14314 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRKCSHP14314 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRKCSHP14314 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRKCSHP14314 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRKCSHP14314 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRKCSHP14314 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRKCSHP14314 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRKCSHP14314 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRKCSHP14314 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRKCSHP14314 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRKCSHP14314 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRKCSHP14314 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRKCSHP14314 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRKCSHP14314 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRKCSHP14314 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PRKCSHP14314 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRKCSHP14314 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRKCSHP14314 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRKCSHP14314 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRKCSHP14314 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRKCSHP14314 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRKCSHP14314 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKCSHP14314 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKCSHP14314 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRKCSHP14314 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRKCSHP14314 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRKCSHP14314 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRKCSHP14314 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKCSHP14314 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRKCSHP14314 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRKCSHP14314 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRKCSHP14314 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRKCSHP14314 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRKCSHP14314 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRKCSHP14314 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRKCSHP14314 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms