Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BMP4P12644 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BMP4P12644 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BMP4P12644 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BMP4P12644 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP4P12644 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BMP4P12644 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP4P12644 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BMP4P12644 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BMP4P12644 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BMP4P12644 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP4P12644 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP4P12644 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BMP4P12644 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BMP4P12644 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP4P12644 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BMP4P12644 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP4P12644 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP4P12644 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BMP4P12644 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BMP4P12644 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP4P12644 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP4P12644 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP4P12644 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP4P12644 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP4P12644 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP4P12644 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BMP4P12644 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BMP4P12644 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP4P12644 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP4P12644 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP4P12644 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP4P12644 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BMP4P12644 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP4P12644 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP4P12644 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP4P12644 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP4P12644 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP4P12644 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP4P12644 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP4P12644 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP4P12644 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP4P12644 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BMP4P12644 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP4P12644 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BMP4P12644 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BMP4P12644 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP4P12644 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMP4P12644 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BMP4P12644 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BMP4P12644 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BMP4P12644 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BMP4P12644 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMP4P12644 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP4P12644 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP4P12644 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP4P12644 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMP4P12644 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP4P12644 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMP4P12644 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMP4P12644 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMP4P12644 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP4P12644 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMP4P12644 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP4P12644 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMP4P12644 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMP4P12644 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMP4P12644 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP4P12644 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMP4P12644 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP4P12644 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMP4P12644 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMP4P12644 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP4P12644 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP4P12644 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BMP4P12644 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMP4P12644 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BMP4P12644 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BMP4P12644 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMP4P12644 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMP4P12644 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMP4P12644 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMP4P12644 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP4P12644 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BMP4P12644 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP4P12644 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP4P12644 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP4P12644 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP4P12644 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP4P12644 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP4P12644 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP4P12644 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP4P12644 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BMP4P12644 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BMP4P12644 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BMP4P12644 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP4P12644 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP4P12644 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP4P12644 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP4P12644 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms