Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HKR1P10072 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HKR1P10072 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKR1P10072 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKR1P10072 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HKR1P10072 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HKR1P10072 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HKR1P10072 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKR1P10072 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKR1P10072 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKR1P10072 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HKR1P10072 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HKR1P10072 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HKR1P10072 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HKR1P10072 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HKR1P10072 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKR1P10072 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKR1P10072 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HKR1P10072 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HKR1P10072 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HKR1P10072 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKR1P10072 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKR1P10072 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKR1P10072 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HKR1P10072 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HKR1P10072 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HKR1P10072 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HKR1P10072 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HKR1P10072 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HKR1P10072 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HKR1P10072 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HKR1P10072 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HKR1P10072 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HKR1P10072 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HKR1P10072 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HKR1P10072 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HKR1P10072 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HKR1P10072 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HKR1P10072 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HKR1P10072 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HKR1P10072 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HKR1P10072 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HKR1P10072 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HKR1P10072 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HKR1P10072 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HKR1P10072 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HKR1P10072 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HKR1P10072 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HKR1P10072 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HKR1P10072 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HKR1P10072 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HKR1P10072 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HKR1P10072 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HKR1P10072 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HKR1P10072 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HKR1P10072 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HKR1P10072 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HKR1P10072 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HKR1P10072 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HKR1P10072 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HKR1P10072 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HKR1P10072 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HKR1P10072 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HKR1P10072 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HKR1P10072 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HKR1P10072 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HKR1P10072 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HKR1P10072 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HKR1P10072 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HKR1P10072 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HKR1P10072 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HKR1P10072 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HKR1P10072 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HKR1P10072 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HKR1P10072 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HKR1P10072 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HKR1P10072 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HKR1P10072 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HKR1P10072 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HKR1P10072 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HKR1P10072 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HKR1P10072 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HKR1P10072 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HKR1P10072 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HKR1P10072 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HKR1P10072 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HKR1P10072 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HKR1P10072 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HKR1P10072 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HKR1P10072 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HKR1P10072 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HKR1P10072 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HKR1P10072 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HKR1P10072 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HKR1P10072 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HKR1P10072 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HKR1P10072 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HKR1P10072 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HKR1P10072 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HKR1P10072 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms