Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC159P0C7I6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC159P0C7I6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC159P0C7I6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC159P0C7I6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC159P0C7I6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC159P0C7I6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC159P0C7I6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC159P0C7I6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC159P0C7I6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC159P0C7I6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC159P0C7I6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC159P0C7I6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC159P0C7I6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC159P0C7I6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC159P0C7I6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC159P0C7I6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC159P0C7I6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC159P0C7I6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC159P0C7I6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC159P0C7I6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC159P0C7I6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC159P0C7I6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC159P0C7I6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC159P0C7I6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC159P0C7I6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC159P0C7I6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC159P0C7I6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC159P0C7I6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC159P0C7I6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC159P0C7I6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC159P0C7I6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC159P0C7I6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC159P0C7I6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC159P0C7I6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC159P0C7I6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC159P0C7I6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC159P0C7I6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC159P0C7I6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC159P0C7I6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC159P0C7I6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC159P0C7I6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC159P0C7I6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC159P0C7I6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC159P0C7I6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC159P0C7I6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC159P0C7I6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC159P0C7I6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC159P0C7I6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC159P0C7I6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC159P0C7I6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC159P0C7I6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC159P0C7I6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC159P0C7I6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC159P0C7I6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC159P0C7I6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC159P0C7I6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC159P0C7I6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC159P0C7I6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC159P0C7I6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC159P0C7I6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms