Protein–RNA interactions for Protein: P09564

CD7, T-cell antigen CD7, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD7P09564 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD7P09564 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD7P09564 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD7P09564 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD7P09564 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD7P09564 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD7P09564 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD7P09564 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD7P09564 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD7P09564 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD7P09564 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD7P09564 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD7P09564 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD7P09564 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD7P09564 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD7P09564 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD7P09564 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD7P09564 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD7P09564 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD7P09564 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD7P09564 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD7P09564 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD7P09564 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD7P09564 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD7P09564 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD7P09564 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD7P09564 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD7P09564 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD7P09564 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD7P09564 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD7P09564 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD7P09564 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD7P09564 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD7P09564 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD7P09564 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD7P09564 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD7P09564 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD7P09564 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD7P09564 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD7P09564 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD7P09564 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD7P09564 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD7P09564 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD7P09564 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD7P09564 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD7P09564 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD7P09564 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD7P09564 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD7P09564 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD7P09564 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD7P09564 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD7P09564 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD7P09564 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD7P09564 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD7P09564 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD7P09564 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD7P09564 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD7P09564 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD7P09564 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD7P09564 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD7P09564 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD7P09564 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD7P09564 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD7P09564 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD7P09564 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD7P09564 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD7P09564 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD7P09564 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD7P09564 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD7P09564 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD7P09564 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD7P09564 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD7P09564 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD7P09564 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD7P09564 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD7P09564 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD7P09564 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD7P09564 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD7P09564 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD7P09564 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD7P09564 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD7P09564 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD7P09564 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD7P09564 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD7P09564 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD7P09564 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD7P09564 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD7P09564 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD7P09564 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD7P09564 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD7P09564 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD7P09564 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD7P09564 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD7P09564 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD7P09564 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD7P09564 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD7P09564 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD7P09564 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD7P09564 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD7P09564 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms