Protein–RNA interactions for Protein: P09234

SNRPC, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPCP09234 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPCP09234 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPCP09234 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPCP09234 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPCP09234 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPCP09234 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPCP09234 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPCP09234 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPCP09234 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPCP09234 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPCP09234 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPCP09234 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPCP09234 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPCP09234 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPCP09234 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPCP09234 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPCP09234 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPCP09234 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPCP09234 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPCP09234 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPCP09234 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPCP09234 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPCP09234 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPCP09234 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPCP09234 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPCP09234 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPCP09234 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPCP09234 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPCP09234 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPCP09234 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPCP09234 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPCP09234 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPCP09234 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPCP09234 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPCP09234 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPCP09234 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPCP09234 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPCP09234 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPCP09234 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPCP09234 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPCP09234 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPCP09234 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPCP09234 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPCP09234 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPCP09234 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms