Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TPM3P06753 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TPM3P06753 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TPM3P06753 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TPM3P06753 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TPM3P06753 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TPM3P06753 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TPM3P06753 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TPM3P06753 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TPM3P06753 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TPM3P06753 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TPM3P06753 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TPM3P06753 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TPM3P06753 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TPM3P06753 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TPM3P06753 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TPM3P06753 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TPM3P06753 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TPM3P06753 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TPM3P06753 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TPM3P06753 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TPM3P06753 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPM3P06753 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPM3P06753 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TPM3P06753 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPM3P06753 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPM3P06753 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPM3P06753 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TPM3P06753 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TPM3P06753 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TPM3P06753 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TPM3P06753 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TPM3P06753 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPM3P06753 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPM3P06753 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPM3P06753 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPM3P06753 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TPM3P06753 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPM3P06753 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPM3P06753 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPM3P06753 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPM3P06753 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TPM3P06753 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TPM3P06753 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TPM3P06753 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TPM3P06753 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TPM3P06753 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPM3P06753 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TPM3P06753 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TPM3P06753 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TPM3P06753 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPM3P06753 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TPM3P06753 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TPM3P06753 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPM3P06753 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPM3P06753 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPM3P06753 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPM3P06753 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPM3P06753 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TPM3P06753 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TPM3P06753 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TPM3P06753 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TPM3P06753 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPM3P06753 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPM3P06753 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPM3P06753 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TPM3P06753 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TPM3P06753 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TPM3P06753 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TPM3P06753 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TPM3P06753 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TPM3P06753 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TPM3P06753 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TPM3P06753 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TPM3P06753 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TPM3P06753 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPM3P06753 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPM3P06753 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TPM3P06753 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TPM3P06753 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TPM3P06753 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TPM3P06753 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TPM3P06753 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TPM3P06753 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TPM3P06753 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TPM3P06753 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TPM3P06753 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TPM3P06753 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPM3P06753 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPM3P06753 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPM3P06753 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TPM3P06753 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TPM3P06753 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPM3P06753 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPM3P06753 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPM3P06753 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TPM3P06753 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TPM3P06753 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TPM3P06753 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TPM3P06753 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms