Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB2P05107 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB2P05107 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB2P05107 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB2P05107 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB2P05107 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB2P05107 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB2P05107 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB2P05107 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB2P05107 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB2P05107 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB2P05107 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB2P05107 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB2P05107 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB2P05107 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB2P05107 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB2P05107 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB2P05107 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB2P05107 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB2P05107 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB2P05107 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB2P05107 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB2P05107 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB2P05107 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB2P05107 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB2P05107 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB2P05107 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB2P05107 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB2P05107 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB2P05107 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB2P05107 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB2P05107 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB2P05107 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB2P05107 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB2P05107 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB2P05107 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB2P05107 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB2P05107 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB2P05107 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB2P05107 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB2P05107 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB2P05107 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB2P05107 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB2P05107 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB2P05107 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB2P05107 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB2P05107 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB2P05107 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB2P05107 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB2P05107 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB2P05107 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB2P05107 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB2P05107 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB2P05107 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB2P05107 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB2P05107 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB2P05107 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB2P05107 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB2P05107 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB2P05107 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB2P05107 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB2P05107 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB2P05107 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB2P05107 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB2P05107 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB2P05107 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB2P05107 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB2P05107 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB2P05107 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB2P05107 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB2P05107 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB2P05107 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB2P05107 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB2P05107 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB2P05107 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB2P05107 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB2P05107 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB2P05107 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB2P05107 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB2P05107 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB2P05107 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB2P05107 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms