Protein–RNA interactions for Protein: P04437

TCRA, T-cell receptor alpha chain V region CTL-L17, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRAP04437 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRAP04437 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRAP04437 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRAP04437 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRAP04437 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRAP04437 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRAP04437 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRAP04437 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRAP04437 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRAP04437 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRAP04437 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRAP04437 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRAP04437 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRAP04437 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRAP04437 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCRAP04437 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRAP04437 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCRAP04437 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCRAP04437 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCRAP04437 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCRAP04437 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRAP04437 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCRAP04437 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCRAP04437 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCRAP04437 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCRAP04437 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRAP04437 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRAP04437 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRAP04437 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRAP04437 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRAP04437 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRAP04437 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRAP04437 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRAP04437 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRAP04437 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRAP04437 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRAP04437 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRAP04437 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRAP04437 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRAP04437 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRAP04437 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRAP04437 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRAP04437 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRAP04437 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRAP04437 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRAP04437 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRAP04437 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRAP04437 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRAP04437 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRAP04437 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRAP04437 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCRAP04437 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCRAP04437 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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TCRAP04437 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRAP04437 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRAP04437 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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TCRAP04437 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRAP04437 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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TCRAP04437 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRAP04437 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRAP04437 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRAP04437 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRAP04437 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRAP04437 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRAP04437 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRAP04437 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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TCRAP04437 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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TCRAP04437 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRAP04437 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRAP04437 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRAP04437 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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TCRAP04437 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRAP04437 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRAP04437 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRAP04437 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRAP04437 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRAP04437 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRAP04437 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRAP04437 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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TCRAP04437 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCRAP04437 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TCRAP04437 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRAP04437 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRAP04437 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCRAP04437 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCRAP04437 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRAP04437 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRAP04437 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCRAP04437 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCRAP04437 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCRAP04437 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCRAP04437 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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