Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMG1P04279 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMG1P04279 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMG1P04279 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMG1P04279 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMG1P04279 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMG1P04279 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMG1P04279 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMG1P04279 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMG1P04279 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMG1P04279 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMG1P04279 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMG1P04279 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMG1P04279 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMG1P04279 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMG1P04279 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMG1P04279 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMG1P04279 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMG1P04279 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMG1P04279 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMG1P04279 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMG1P04279 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMG1P04279 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMG1P04279 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMG1P04279 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMG1P04279 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMG1P04279 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMG1P04279 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMG1P04279 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMG1P04279 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMG1P04279 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMG1P04279 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMG1P04279 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMG1P04279 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMG1P04279 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMG1P04279 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMG1P04279 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMG1P04279 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMG1P04279 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMG1P04279 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMG1P04279 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMG1P04279 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMG1P04279 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMG1P04279 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMG1P04279 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMG1P04279 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMG1P04279 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms