Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HRGP04196 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HRGP04196 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HRGP04196 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HRGP04196 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HRGP04196 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HRGP04196 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HRGP04196 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HRGP04196 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HRGP04196 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HRGP04196 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HRGP04196 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HRGP04196 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HRGP04196 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HRGP04196 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HRGP04196 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HRGP04196 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HRGP04196 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HRGP04196 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HRGP04196 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HRGP04196 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HRGP04196 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HRGP04196 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HRGP04196 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HRGP04196 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HRGP04196 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HRGP04196 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HRGP04196 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRGP04196 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HRGP04196 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HRGP04196 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HRGP04196 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HRGP04196 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HRGP04196 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HRGP04196 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HRGP04196 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HRGP04196 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HRGP04196 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HRGP04196 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HRGP04196 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HRGP04196 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRGP04196 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HRGP04196 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HRGP04196 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRGP04196 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRGP04196 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRGP04196 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HRGP04196 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HRGP04196 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HRGP04196 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HRGP04196 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HRGP04196 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HRGP04196 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HRGP04196 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HRGP04196 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HRGP04196 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HRGP04196 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HRGP04196 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HRGP04196 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HRGP04196 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HRGP04196 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HRGP04196 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HRGP04196 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRGP04196 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HRGP04196 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HRGP04196 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HRGP04196 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HRGP04196 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRGP04196 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRGP04196 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HRGP04196 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HRGP04196 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRGP04196 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRGP04196 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HRGP04196 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HRGP04196 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HRGP04196 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HRGP04196 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HRGP04196 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HRGP04196 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HRGP04196 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRGP04196 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRGP04196 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HRGP04196 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HRGP04196 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HRGP04196 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HRGP04196 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HRGP04196 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HRGP04196 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HRGP04196 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRGP04196 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRGP04196 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRGP04196 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRGP04196 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRGP04196 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRGP04196 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRGP04196 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRGP04196 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRGP04196 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRGP04196 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms