Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAF1P04049 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAF1P04049 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAF1P04049 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAF1P04049 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAF1P04049 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAF1P04049 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAF1P04049 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAF1P04049 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAF1P04049 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAF1P04049 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAF1P04049 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAF1P04049 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAF1P04049 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAF1P04049 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAF1P04049 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAF1P04049 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAF1P04049 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAF1P04049 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAF1P04049 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAF1P04049 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAF1P04049 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAF1P04049 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAF1P04049 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAF1P04049 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAF1P04049 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAF1P04049 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAF1P04049 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAF1P04049 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAF1P04049 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAF1P04049 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAF1P04049 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAF1P04049 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAF1P04049 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAF1P04049 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAF1P04049 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAF1P04049 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAF1P04049 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAF1P04049 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAF1P04049 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAF1P04049 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAF1P04049 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAF1P04049 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAF1P04049 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAF1P04049 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAF1P04049 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAF1P04049 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAF1P04049 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAF1P04049 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAF1P04049 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAF1P04049 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAF1P04049 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAF1P04049 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAF1P04049 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAF1P04049 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAF1P04049 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAF1P04049 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAF1P04049 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAF1P04049 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAF1P04049 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAF1P04049 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAF1P04049 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAF1P04049 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAF1P04049 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAF1P04049 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAF1P04049 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAF1P04049 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAF1P04049 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAF1P04049 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAF1P04049 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAF1P04049 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAF1P04049 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAF1P04049 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAF1P04049 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAF1P04049 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAF1P04049 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAF1P04049 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAF1P04049 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAF1P04049 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAF1P04049 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAF1P04049 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAF1P04049 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAF1P04049 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAF1P04049 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAF1P04049 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAF1P04049 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAF1P04049 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAF1P04049 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAF1P04049 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAF1P04049 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAF1P04049 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAF1P04049 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAF1P04049 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAF1P04049 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAF1P04049 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAF1P04049 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAF1P04049 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAF1P04049 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAF1P04049 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAF1P04049 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms