Protein–RNA interactions for Protein: P03905

MT-ND4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND4P03905 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MT-ND4P03905 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MT-ND4P03905 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MT-ND4P03905 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MT-ND4P03905 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MT-ND4P03905 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND4P03905 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MT-ND4P03905 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MT-ND4P03905 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MT-ND4P03905 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MT-ND4P03905 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MT-ND4P03905 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-ND4P03905 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MT-ND4P03905 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MT-ND4P03905 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MT-ND4P03905 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-ND4P03905 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-ND4P03905 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-ND4P03905 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-ND4P03905 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-ND4P03905 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-ND4P03905 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MT-ND4P03905 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-ND4P03905 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-ND4P03905 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND4P03905 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MT-ND4P03905 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND4P03905 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MT-ND4P03905 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MT-ND4P03905 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MT-ND4P03905 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND4P03905 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND4P03905 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MT-ND4P03905 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MT-ND4P03905 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND4P03905 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MT-ND4P03905 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND4P03905 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MT-ND4P03905 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MT-ND4P03905 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MT-ND4P03905 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MT-ND4P03905 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MT-ND4P03905 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MT-ND4P03905 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MT-ND4P03905 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MT-ND4P03905 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MT-ND4P03905 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MT-ND4P03905 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MT-ND4P03905 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND4P03905 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-ND4P03905 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-ND4P03905 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND4P03905 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND4P03905 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-ND4P03905 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MT-ND4P03905 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND4P03905 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-ND4P03905 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms