Protein–RNA interactions for Protein: O95231

VENTX, Homeobox protein VENTX, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXO95231 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VENTXO95231 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VENTXO95231 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VENTXO95231 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VENTXO95231 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VENTXO95231 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VENTXO95231 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VENTXO95231 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VENTXO95231 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VENTXO95231 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VENTXO95231 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VENTXO95231 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VENTXO95231 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VENTXO95231 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VENTXO95231 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VENTXO95231 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VENTXO95231 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VENTXO95231 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VENTXO95231 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VENTXO95231 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VENTXO95231 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VENTXO95231 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VENTXO95231 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VENTXO95231 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VENTXO95231 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VENTXO95231 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VENTXO95231 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VENTXO95231 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VENTXO95231 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VENTXO95231 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VENTXO95231 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VENTXO95231 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VENTXO95231 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VENTXO95231 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VENTXO95231 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VENTXO95231 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VENTXO95231 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VENTXO95231 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VENTXO95231 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VENTXO95231 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VENTXO95231 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VENTXO95231 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VENTXO95231 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VENTXO95231 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VENTXO95231 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VENTXO95231 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VENTXO95231 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VENTXO95231 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VENTXO95231 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VENTXO95231 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VENTXO95231 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VENTXO95231 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VENTXO95231 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VENTXO95231 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VENTXO95231 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VENTXO95231 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VENTXO95231 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VENTXO95231 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VENTXO95231 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VENTXO95231 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VENTXO95231 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VENTXO95231 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VENTXO95231 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VENTXO95231 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VENTXO95231 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VENTXO95231 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VENTXO95231 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VENTXO95231 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VENTXO95231 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VENTXO95231 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VENTXO95231 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VENTXO95231 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VENTXO95231 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VENTXO95231 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VENTXO95231 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VENTXO95231 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VENTXO95231 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VENTXO95231 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VENTXO95231 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VENTXO95231 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VENTXO95231 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VENTXO95231 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VENTXO95231 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VENTXO95231 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VENTXO95231 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VENTXO95231 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VENTXO95231 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VENTXO95231 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VENTXO95231 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VENTXO95231 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VENTXO95231 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VENTXO95231 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VENTXO95231 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VENTXO95231 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VENTXO95231 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VENTXO95231 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VENTXO95231 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VENTXO95231 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VENTXO95231 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VENTXO95231 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms