Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNUPNO95149 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNUPNO95149 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNUPNO95149 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNUPNO95149 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNUPNO95149 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNUPNO95149 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNUPNO95149 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNUPNO95149 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNUPNO95149 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNUPNO95149 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNUPNO95149 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNUPNO95149 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SNUPNO95149 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNUPNO95149 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNUPNO95149 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNUPNO95149 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNUPNO95149 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNUPNO95149 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNUPNO95149 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNUPNO95149 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNUPNO95149 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNUPNO95149 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNUPNO95149 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNUPNO95149 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNUPNO95149 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNUPNO95149 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNUPNO95149 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNUPNO95149 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNUPNO95149 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNUPNO95149 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNUPNO95149 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNUPNO95149 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNUPNO95149 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNUPNO95149 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNUPNO95149 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SNUPNO95149 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNUPNO95149 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SNUPNO95149 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNUPNO95149 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNUPNO95149 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNUPNO95149 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SNUPNO95149 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNUPNO95149 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNUPNO95149 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNUPNO95149 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNUPNO95149 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNUPNO95149 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNUPNO95149 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SNUPNO95149 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNUPNO95149 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNUPNO95149 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNUPNO95149 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNUPNO95149 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNUPNO95149 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNUPNO95149 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNUPNO95149 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNUPNO95149 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNUPNO95149 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNUPNO95149 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNUPNO95149 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNUPNO95149 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNUPNO95149 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms