Protein–RNA interactions for Protein: O76075

DFFB, DNA fragmentation factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFBO76075 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DFFBO76075 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DFFBO76075 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DFFBO76075 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFBO76075 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DFFBO76075 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DFFBO76075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DFFBO76075 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFBO76075 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DFFBO76075 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DFFBO76075 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DFFBO76075 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DFFBO76075 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DFFBO76075 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFBO76075 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFBO76075 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DFFBO76075 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFBO76075 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFBO76075 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DFFBO76075 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFBO76075 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DFFBO76075 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DFFBO76075 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DFFBO76075 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DFFBO76075 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DFFBO76075 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DFFBO76075 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFBO76075 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DFFBO76075 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DFFBO76075 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DFFBO76075 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DFFBO76075 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DFFBO76075 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFBO76075 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFBO76075 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DFFBO76075 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFBO76075 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DFFBO76075 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DFFBO76075 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DFFBO76075 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFBO76075 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFBO76075 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFBO76075 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DFFBO76075 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFBO76075 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFBO76075 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFBO76075 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFBO76075 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DFFBO76075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DFFBO76075 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFBO76075 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DFFBO76075 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFBO76075 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFBO76075 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DFFBO76075 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DFFBO76075 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DFFBO76075 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFBO76075 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFBO76075 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFBO76075 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DFFBO76075 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DFFBO76075 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFBO76075 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DFFBO76075 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DFFBO76075 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFBO76075 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFBO76075 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DFFBO76075 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFBO76075 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DFFBO76075 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFBO76075 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFBO76075 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFBO76075 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFBO76075 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFBO76075 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DFFBO76075 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFBO76075 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFBO76075 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DFFBO76075 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFBO76075 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFBO76075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFBO76075 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DFFBO76075 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DFFBO76075 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DFFBO76075 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFBO76075 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFBO76075 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFBO76075 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFBO76075 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFBO76075 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFBO76075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFBO76075 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFBO76075 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFBO76075 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFBO76075 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFBO76075 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFBO76075 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFBO76075 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DFFBO76075 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFFBO76075 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms