Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP2O75604 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP2O75604 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP2O75604 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP2O75604 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP2O75604 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP2O75604 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP2O75604 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP2O75604 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP2O75604 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP2O75604 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP2O75604 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP2O75604 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP2O75604 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP2O75604 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP2O75604 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP2O75604 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP2O75604 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP2O75604 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP2O75604 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
USP2O75604 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP2O75604 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP2O75604 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP2O75604 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP2O75604 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
USP2O75604 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP2O75604 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP2O75604 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP2O75604 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP2O75604 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP2O75604 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP2O75604 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP2O75604 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP2O75604 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
USP2O75604 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP2O75604 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP2O75604 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
USP2O75604 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
USP2O75604 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP2O75604 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP2O75604 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP2O75604 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP2O75604 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP2O75604 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP2O75604 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP2O75604 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP2O75604 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP2O75604 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP2O75604 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP2O75604 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP2O75604 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP2O75604 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP2O75604 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP2O75604 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP2O75604 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP2O75604 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
USP2O75604 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP2O75604 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP2O75604 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP2O75604 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP2O75604 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP2O75604 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP2O75604 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP2O75604 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP2O75604 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP2O75604 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP2O75604 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP2O75604 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP2O75604 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
USP2O75604 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.77■■■■□ 3
USP2O75604 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
USP2O75604 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP2O75604 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP2O75604 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP2O75604 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP2O75604 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP2O75604 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP2O75604 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP2O75604 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP2O75604 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP2O75604 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP2O75604 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP2O75604 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP2O75604 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP2O75604 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
USP2O75604 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP2O75604 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP2O75604 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
USP2O75604 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP2O75604 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP2O75604 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP2O75604 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP2O75604 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP2O75604 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP2O75604 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP2O75604 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP2O75604 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP2O75604 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP2O75604 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP2O75604 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms