Protein–RNA interactions for Protein: O75380

NDUFS6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS6O75380 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS6O75380 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS6O75380 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS6O75380 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS6O75380 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS6O75380 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS6O75380 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS6O75380 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFS6O75380 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS6O75380 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS6O75380 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS6O75380 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS6O75380 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS6O75380 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS6O75380 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS6O75380 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS6O75380 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS6O75380 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS6O75380 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS6O75380 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFS6O75380 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFS6O75380 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFS6O75380 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFS6O75380 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFS6O75380 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFS6O75380 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFS6O75380 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFS6O75380 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS6O75380 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS6O75380 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS6O75380 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS6O75380 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS6O75380 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS6O75380 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS6O75380 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS6O75380 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS6O75380 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS6O75380 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS6O75380 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS6O75380 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS6O75380 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS6O75380 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS6O75380 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFS6O75380 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFS6O75380 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFS6O75380 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms