Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM17BO60830 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM17BO60830 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TIMM17BO60830 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TIMM17BO60830 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TIMM17BO60830 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TIMM17BO60830 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TIMM17BO60830 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TIMM17BO60830 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TIMM17BO60830 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TIMM17BO60830 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TIMM17BO60830 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TIMM17BO60830 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TIMM17BO60830 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM17BO60830 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM17BO60830 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM17BO60830 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM17BO60830 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM17BO60830 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM17BO60830 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM17BO60830 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM17BO60830 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM17BO60830 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM17BO60830 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM17BO60830 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM17BO60830 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM17BO60830 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM17BO60830 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TIMM17BO60830 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TIMM17BO60830 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TIMM17BO60830 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TIMM17BO60830 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TIMM17BO60830 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM17BO60830 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM17BO60830 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM17BO60830 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM17BO60830 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM17BO60830 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM17BO60830 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM17BO60830 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM17BO60830 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM17BO60830 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM17BO60830 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TIMM17BO60830 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TIMM17BO60830 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms