Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LANCL1O43813 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LANCL1O43813 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LANCL1O43813 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LANCL1O43813 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LANCL1O43813 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LANCL1O43813 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LANCL1O43813 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LANCL1O43813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LANCL1O43813 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LANCL1O43813 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LANCL1O43813 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LANCL1O43813 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LANCL1O43813 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LANCL1O43813 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LANCL1O43813 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LANCL1O43813 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LANCL1O43813 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LANCL1O43813 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LANCL1O43813 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LANCL1O43813 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LANCL1O43813 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LANCL1O43813 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LANCL1O43813 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LANCL1O43813 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LANCL1O43813 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LANCL1O43813 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LANCL1O43813 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LANCL1O43813 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LANCL1O43813 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LANCL1O43813 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LANCL1O43813 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LANCL1O43813 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LANCL1O43813 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LANCL1O43813 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LANCL1O43813 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LANCL1O43813 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LANCL1O43813 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LANCL1O43813 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LANCL1O43813 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LANCL1O43813 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LANCL1O43813 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LANCL1O43813 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LANCL1O43813 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LANCL1O43813 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LANCL1O43813 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LANCL1O43813 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LANCL1O43813 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LANCL1O43813 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LANCL1O43813 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LANCL1O43813 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LANCL1O43813 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LANCL1O43813 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LANCL1O43813 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LANCL1O43813 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LANCL1O43813 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LANCL1O43813 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LANCL1O43813 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LANCL1O43813 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms