Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CYTH3O43739 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CYTH3O43739 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CYTH3O43739 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CYTH3O43739 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CYTH3O43739 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CYTH3O43739 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CYTH3O43739 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CYTH3O43739 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CYTH3O43739 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CYTH3O43739 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CYTH3O43739 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CYTH3O43739 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CYTH3O43739 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CYTH3O43739 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CYTH3O43739 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CYTH3O43739 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CYTH3O43739 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CYTH3O43739 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CYTH3O43739 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CYTH3O43739 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CYTH3O43739 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CYTH3O43739 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CYTH3O43739 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CYTH3O43739 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CYTH3O43739 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CYTH3O43739 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CYTH3O43739 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CYTH3O43739 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CYTH3O43739 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CYTH3O43739 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CYTH3O43739 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CYTH3O43739 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CYTH3O43739 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CYTH3O43739 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CYTH3O43739 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CYTH3O43739 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CYTH3O43739 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CYTH3O43739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CYTH3O43739 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CYTH3O43739 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CYTH3O43739 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CYTH3O43739 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CYTH3O43739 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CYTH3O43739 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CYTH3O43739 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CYTH3O43739 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CYTH3O43739 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CYTH3O43739 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CYTH3O43739 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CYTH3O43739 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CYTH3O43739 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CYTH3O43739 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CYTH3O43739 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CYTH3O43739 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CYTH3O43739 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CYTH3O43739 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CYTH3O43739 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CYTH3O43739 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CYTH3O43739 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CYTH3O43739 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CYTH3O43739 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CYTH3O43739 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CYTH3O43739 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CYTH3O43739 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CYTH3O43739 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CYTH3O43739 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CYTH3O43739 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CYTH3O43739 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CYTH3O43739 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CYTH3O43739 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CYTH3O43739 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CYTH3O43739 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CYTH3O43739 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CYTH3O43739 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CYTH3O43739 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CYTH3O43739 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CYTH3O43739 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CYTH3O43739 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CYTH3O43739 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CYTH3O43739 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CYTH3O43739 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CYTH3O43739 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CYTH3O43739 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CYTH3O43739 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CYTH3O43739 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CYTH3O43739 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CYTH3O43739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CYTH3O43739 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CYTH3O43739 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CYTH3O43739 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CYTH3O43739 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms