Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLF4O43474 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLF4O43474 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLF4O43474 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLF4O43474 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLF4O43474 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLF4O43474 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLF4O43474 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLF4O43474 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLF4O43474 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLF4O43474 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLF4O43474 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLF4O43474 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLF4O43474 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLF4O43474 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF4O43474 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLF4O43474 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLF4O43474 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLF4O43474 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLF4O43474 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF4O43474 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLF4O43474 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLF4O43474 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLF4O43474 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF4O43474 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLF4O43474 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLF4O43474 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLF4O43474 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLF4O43474 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLF4O43474 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLF4O43474 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLF4O43474 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLF4O43474 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLF4O43474 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLF4O43474 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLF4O43474 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLF4O43474 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLF4O43474 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLF4O43474 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLF4O43474 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF4O43474 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLF4O43474 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLF4O43474 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLF4O43474 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF4O43474 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KLF4O43474 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLF4O43474 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLF4O43474 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF4O43474 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF4O43474 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLF4O43474 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLF4O43474 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF4O43474 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF4O43474 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF4O43474 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLF4O43474 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLF4O43474 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLF4O43474 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLF4O43474 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLF4O43474 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLF4O43474 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLF4O43474 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLF4O43474 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLF4O43474 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLF4O43474 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLF4O43474 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLF4O43474 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLF4O43474 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLF4O43474 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF4O43474 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF4O43474 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLF4O43474 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLF4O43474 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLF4O43474 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLF4O43474 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLF4O43474 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLF4O43474 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLF4O43474 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLF4O43474 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLF4O43474 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLF4O43474 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLF4O43474 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLF4O43474 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLF4O43474 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF4O43474 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF4O43474 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF4O43474 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF4O43474 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF4O43474 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF4O43474 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF4O43474 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF4O43474 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF4O43474 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF4O43474 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF4O43474 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF4O43474 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF4O43474 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF4O43474 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF4O43474 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF4O43474 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms