Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNAB3O43448 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNAB3O43448 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNAB3O43448 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNAB3O43448 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNAB3O43448 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNAB3O43448 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNAB3O43448 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNAB3O43448 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNAB3O43448 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNAB3O43448 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNAB3O43448 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNAB3O43448 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNAB3O43448 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNAB3O43448 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNAB3O43448 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNAB3O43448 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNAB3O43448 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNAB3O43448 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNAB3O43448 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNAB3O43448 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNAB3O43448 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNAB3O43448 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNAB3O43448 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNAB3O43448 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNAB3O43448 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNAB3O43448 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNAB3O43448 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNAB3O43448 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNAB3O43448 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNAB3O43448 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNAB3O43448 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNAB3O43448 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNAB3O43448 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNAB3O43448 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNAB3O43448 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNAB3O43448 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNAB3O43448 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNAB3O43448 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNAB3O43448 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNAB3O43448 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNAB3O43448 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms