Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GPAA1O43292 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GPAA1O43292 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GPAA1O43292 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GPAA1O43292 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GPAA1O43292 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GPAA1O43292 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GPAA1O43292 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GPAA1O43292 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GPAA1O43292 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GPAA1O43292 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GPAA1O43292 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GPAA1O43292 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GPAA1O43292 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GPAA1O43292 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GPAA1O43292 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
GPAA1O43292 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GPAA1O43292 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GPAA1O43292 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GPAA1O43292 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GPAA1O43292 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GPAA1O43292 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GPAA1O43292 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GPAA1O43292 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GPAA1O43292 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GPAA1O43292 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GPAA1O43292 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GPAA1O43292 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GPAA1O43292 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GPAA1O43292 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GPAA1O43292 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GPAA1O43292 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GPAA1O43292 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GPAA1O43292 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GPAA1O43292 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
GPAA1O43292 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GPAA1O43292 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GPAA1O43292 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GPAA1O43292 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GPAA1O43292 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GPAA1O43292 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GPAA1O43292 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GPAA1O43292 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GPAA1O43292 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GPAA1O43292 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GPAA1O43292 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GPAA1O43292 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GPAA1O43292 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GPAA1O43292 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GPAA1O43292 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GPAA1O43292 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPAA1O43292 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GPAA1O43292 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPAA1O43292 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPAA1O43292 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GPAA1O43292 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GPAA1O43292 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GPAA1O43292 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GPAA1O43292 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPAA1O43292 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GPAA1O43292 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPAA1O43292 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GPAA1O43292 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GPAA1O43292 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GPAA1O43292 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GPAA1O43292 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
GPAA1O43292 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GPAA1O43292 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GPAA1O43292 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GPAA1O43292 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GPAA1O43292 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GPAA1O43292 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GPAA1O43292 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GPAA1O43292 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GPAA1O43292 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GPAA1O43292 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GPAA1O43292 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GPAA1O43292 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GPAA1O43292 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GPAA1O43292 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GPAA1O43292 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GPAA1O43292 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GPAA1O43292 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GPAA1O43292 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GPAA1O43292 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GPAA1O43292 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GPAA1O43292 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GPAA1O43292 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GPAA1O43292 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GPAA1O43292 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GPAA1O43292 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GPAA1O43292 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
GPAA1O43292 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms