Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRXO43186 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRXO43186 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRXO43186 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRXO43186 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRXO43186 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRXO43186 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRXO43186 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRXO43186 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRXO43186 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRXO43186 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRXO43186 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRXO43186 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRXO43186 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRXO43186 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRXO43186 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRXO43186 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRXO43186 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRXO43186 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRXO43186 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRXO43186 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRXO43186 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRXO43186 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRXO43186 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRXO43186 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRXO43186 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRXO43186 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRXO43186 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRXO43186 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRXO43186 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRXO43186 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRXO43186 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRXO43186 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRXO43186 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRXO43186 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRXO43186 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRXO43186 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRXO43186 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRXO43186 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CRXO43186 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRXO43186 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRXO43186 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRXO43186 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRXO43186 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRXO43186 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRXO43186 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRXO43186 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRXO43186 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CRXO43186 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRXO43186 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRXO43186 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRXO43186 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRXO43186 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRXO43186 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRXO43186 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRXO43186 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRXO43186 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRXO43186 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRXO43186 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRXO43186 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRXO43186 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRXO43186 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRXO43186 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRXO43186 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRXO43186 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRXO43186 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRXO43186 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRXO43186 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRXO43186 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRXO43186 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRXO43186 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRXO43186 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRXO43186 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRXO43186 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRXO43186 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRXO43186 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRXO43186 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRXO43186 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRXO43186 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRXO43186 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRXO43186 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRXO43186 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRXO43186 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRXO43186 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRXO43186 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRXO43186 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRXO43186 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRXO43186 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRXO43186 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRXO43186 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRXO43186 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRXO43186 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRXO43186 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRXO43186 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CRXO43186 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRXO43186 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRXO43186 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRXO43186 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRXO43186 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRXO43186 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms