Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
KDM6BO15054 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
KDM6BO15054 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
KDM6BO15054 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
KDM6BO15054 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
KDM6BO15054 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
KDM6BO15054 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
KDM6BO15054 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
KDM6BO15054 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC46.32■■■■■ 5
KDM6BO15054 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.28■■■■■ 5
KDM6BO15054 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
KDM6BO15054 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
KDM6BO15054 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
KDM6BO15054 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC46.1■■■■■ 4.97
KDM6BO15054 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
KDM6BO15054 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
KDM6BO15054 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
KDM6BO15054 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
KDM6BO15054 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
KDM6BO15054 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
KDM6BO15054 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
KDM6BO15054 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
KDM6BO15054 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.93
KDM6BO15054 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
KDM6BO15054 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC45.87■■■■■ 4.93
KDM6BO15054 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
KDM6BO15054 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
KDM6BO15054 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
KDM6BO15054 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
KDM6BO15054 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
KDM6BO15054 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
KDM6BO15054 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
KDM6BO15054 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45.63■■■■■ 4.89
KDM6BO15054 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
KDM6BO15054 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
KDM6BO15054 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
KDM6BO15054 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
KDM6BO15054 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
KDM6BO15054 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
KDM6BO15054 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
KDM6BO15054 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
KDM6BO15054 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
KDM6BO15054 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
KDM6BO15054 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
KDM6BO15054 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
KDM6BO15054 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
KDM6BO15054 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
KDM6BO15054 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
KDM6BO15054 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
KDM6BO15054 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
KDM6BO15054 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
KDM6BO15054 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
KDM6BO15054 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
KDM6BO15054 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
KDM6BO15054 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
KDM6BO15054 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
KDM6BO15054 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
KDM6BO15054 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
KDM6BO15054 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
KDM6BO15054 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
KDM6BO15054 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
KDM6BO15054 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
KDM6BO15054 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
KDM6BO15054 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
KDM6BO15054 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
KDM6BO15054 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
KDM6BO15054 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
KDM6BO15054 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
KDM6BO15054 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
KDM6BO15054 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
KDM6BO15054 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
KDM6BO15054 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
KDM6BO15054 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
KDM6BO15054 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.94■■■■■ 4.79
KDM6BO15054 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
KDM6BO15054 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.88■■■■■ 4.78
KDM6BO15054 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.82■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
KDM6BO15054 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
KDM6BO15054 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
KDM6BO15054 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
KDM6BO15054 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
KDM6BO15054 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
KDM6BO15054 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
KDM6BO15054 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
KDM6BO15054 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
KDM6BO15054 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
KDM6BO15054 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
KDM6BO15054 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
KDM6BO15054 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
KDM6BO15054 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
KDM6BO15054 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
KDM6BO15054 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.58■■■■■ 4.73
KDM6BO15054 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms