Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
E2F3O00716 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E2F3O00716 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F3O00716 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F3O00716 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E2F3O00716 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F3O00716 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E2F3O00716 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E2F3O00716 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E2F3O00716 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E2F3O00716 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
E2F3O00716 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E2F3O00716 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
E2F3O00716 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E2F3O00716 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
E2F3O00716 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
E2F3O00716 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E2F3O00716 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
E2F3O00716 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E2F3O00716 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
E2F3O00716 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
E2F3O00716 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
E2F3O00716 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
E2F3O00716 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
E2F3O00716 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E2F3O00716 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E2F3O00716 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
E2F3O00716 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F3O00716 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F3O00716 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
E2F3O00716 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F3O00716 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
E2F3O00716 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
E2F3O00716 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F3O00716 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F3O00716 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
E2F3O00716 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E2F3O00716 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E2F3O00716 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
E2F3O00716 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F3O00716 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F3O00716 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F3O00716 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E2F3O00716 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
E2F3O00716 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E2F3O00716 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E2F3O00716 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E2F3O00716 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E2F3O00716 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E2F3O00716 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
E2F3O00716 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
E2F3O00716 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E2F3O00716 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E2F3O00716 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E2F3O00716 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F3O00716 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E2F3O00716 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F3O00716 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E2F3O00716 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F3O00716 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E2F3O00716 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
E2F3O00716 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E2F3O00716 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F3O00716 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E2F3O00716 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E2F3O00716 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E2F3O00716 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E2F3O00716 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E2F3O00716 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E2F3O00716 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F3O00716 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F3O00716 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F3O00716 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E2F3O00716 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F3O00716 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F3O00716 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F3O00716 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E2F3O00716 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F3O00716 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F3O00716 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F3O00716 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F3O00716 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F3O00716 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F3O00716 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F3O00716 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F3O00716 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F3O00716 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F3O00716 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F3O00716 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F3O00716 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F3O00716 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
E2F3O00716 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F3O00716 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F3O00716 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F3O00716 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F3O00716 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F3O00716 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F3O00716 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F3O00716 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F3O00716 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms