Protein–RNA interactions for Protein: O00151

PDLIM1, PDZ and LIM domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM1O00151 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDLIM1O00151 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM1O00151 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDLIM1O00151 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDLIM1O00151 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM1O00151 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM1O00151 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM1O00151 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM1O00151 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM1O00151 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM1O00151 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDLIM1O00151 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM1O00151 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDLIM1O00151 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM1O00151 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM1O00151 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM1O00151 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM1O00151 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM1O00151 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM1O00151 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM1O00151 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDLIM1O00151 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM1O00151 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM1O00151 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM1O00151 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM1O00151 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM1O00151 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM1O00151 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM1O00151 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM1O00151 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM1O00151 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM1O00151 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM1O00151 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDLIM1O00151 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM1O00151 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDLIM1O00151 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM1O00151 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM1O00151 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM1O00151 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDLIM1O00151 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDLIM1O00151 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDLIM1O00151 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDLIM1O00151 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDLIM1O00151 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDLIM1O00151 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDLIM1O00151 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDLIM1O00151 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDLIM1O00151 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDLIM1O00151 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDLIM1O00151 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDLIM1O00151 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDLIM1O00151 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM1O00151 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM1O00151 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDLIM1O00151 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDLIM1O00151 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDLIM1O00151 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDLIM1O00151 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDLIM1O00151 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDLIM1O00151 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM1O00151 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM1O00151 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDLIM1O00151 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDLIM1O00151 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDLIM1O00151 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM1O00151 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDLIM1O00151 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDLIM1O00151 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDLIM1O00151 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM1O00151 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM1O00151 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms