Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms