Protein–RNA interactions for Protein: H0YC42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YC42 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H0YC42 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
H0YC42 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H0YC42 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H0YC42 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H0YC42 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H0YC42 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H0YC42 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H0YC42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H0YC42 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H0YC42 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H0YC42 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H0YC42 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H0YC42 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H0YC42 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H0YC42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H0YC42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
H0YC42 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H0YC42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H0YC42 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H0YC42 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H0YC42 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
H0YC42 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
H0YC42 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H0YC42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H0YC42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H0YC42 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H0YC42 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H0YC42 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H0YC42 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H0YC42 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H0YC42 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H0YC42 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H0YC42 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H0YC42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H0YC42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H0YC42 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H0YC42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H0YC42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H0YC42 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H0YC42 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H0YC42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H0YC42 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H0YC42 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YC42 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YC42 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H0YC42 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H0YC42 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H0YC42 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H0YC42 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H0YC42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H0YC42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H0YC42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H0YC42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YC42 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YC42 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H0YC42 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H0YC42 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H0YC42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H0YC42 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H0YC42 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H0YC42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H0YC42 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H0YC42 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H0YC42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H0YC42 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H0YC42 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H0YC42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H0YC42 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
H0YC42 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H0YC42 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H0YC42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H0YC42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H0YC42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H0YC42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H0YC42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H0YC42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H0YC42 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H0YC42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H0YC42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H0YC42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H0YC42 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H0YC42 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H0YC42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H0YC42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H0YC42 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H0YC42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H0YC42 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H0YC42 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H0YC42 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H0YC42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H0YC42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H0YC42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H0YC42 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H0YC42 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H0YC42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H0YC42 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H0YC42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H0YC42 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H0YC42 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms