Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRBOX1C9JBD0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRBOX1C9JBD0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRBOX1C9JBD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRBOX1C9JBD0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBOX1C9JBD0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRBOX1C9JBD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBOX1C9JBD0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRBOX1C9JBD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRBOX1C9JBD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBOX1C9JBD0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBOX1C9JBD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBOX1C9JBD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBOX1C9JBD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBOX1C9JBD0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBOX1C9JBD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBOX1C9JBD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBOX1C9JBD0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBOX1C9JBD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBOX1C9JBD0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRBOX1C9JBD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRBOX1C9JBD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRBOX1C9JBD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBOX1C9JBD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRBOX1C9JBD0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBOX1C9JBD0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRBOX1C9JBD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRBOX1C9JBD0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRBOX1C9JBD0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRBOX1C9JBD0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX1C9JBD0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRBOX1C9JBD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRBOX1C9JBD0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRBOX1C9JBD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRBOX1C9JBD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRBOX1C9JBD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRBOX1C9JBD0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRBOX1C9JBD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBOX1C9JBD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBOX1C9JBD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBOX1C9JBD0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBOX1C9JBD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBOX1C9JBD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRBOX1C9JBD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRBOX1C9JBD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRBOX1C9JBD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX1C9JBD0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX1C9JBD0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRBOX1C9JBD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRBOX1C9JBD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRBOX1C9JBD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRBOX1C9JBD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRBOX1C9JBD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRBOX1C9JBD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms