Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC66A2RUB6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC66A2RUB6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC66A2RUB6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC66A2RUB6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC66A2RUB6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC66A2RUB6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC66A2RUB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC66A2RUB6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC66A2RUB6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC66A2RUB6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC66A2RUB6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC66A2RUB6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC66A2RUB6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC66A2RUB6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC66A2RUB6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC66A2RUB6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC66A2RUB6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC66A2RUB6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC66A2RUB6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC66A2RUB6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC66A2RUB6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC66A2RUB6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC66A2RUB6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC66A2RUB6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC66A2RUB6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC66A2RUB6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC66A2RUB6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC66A2RUB6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CCDC66A2RUB6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC66A2RUB6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC66A2RUB6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC66A2RUB6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC66A2RUB6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC66A2RUB6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC66A2RUB6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC66A2RUB6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC66A2RUB6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC66A2RUB6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC66A2RUB6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC66A2RUB6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC66A2RUB6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC66A2RUB6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC66A2RUB6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC66A2RUB6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC66A2RUB6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC66A2RUB6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC66A2RUB6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC66A2RUB6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC66A2RUB6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC66A2RUB6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC66A2RUB6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC66A2RUB6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC66A2RUB6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC66A2RUB6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC66A2RUB6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC66A2RUB6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC66A2RUB6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms