Protein–RNA interactions for Protein: A2A2V5

SERTM1, Serine-rich and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTM1A2A2V5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SERTM1A2A2V5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERTM1A2A2V5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERTM1A2A2V5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERTM1A2A2V5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERTM1A2A2V5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERTM1A2A2V5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERTM1A2A2V5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERTM1A2A2V5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERTM1A2A2V5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERTM1A2A2V5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERTM1A2A2V5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SERTM1A2A2V5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SERTM1A2A2V5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SERTM1A2A2V5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERTM1A2A2V5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERTM1A2A2V5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SERTM1A2A2V5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SERTM1A2A2V5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERTM1A2A2V5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERTM1A2A2V5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SERTM1A2A2V5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERTM1A2A2V5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SERTM1A2A2V5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SERTM1A2A2V5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SERTM1A2A2V5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SERTM1A2A2V5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SERTM1A2A2V5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SERTM1A2A2V5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SERTM1A2A2V5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SERTM1A2A2V5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SERTM1A2A2V5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SERTM1A2A2V5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SERTM1A2A2V5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SERTM1A2A2V5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SERTM1A2A2V5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERTM1A2A2V5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERTM1A2A2V5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SERTM1A2A2V5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERTM1A2A2V5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SERTM1A2A2V5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SERTM1A2A2V5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTM1A2A2V5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SERTM1A2A2V5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERTM1A2A2V5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SERTM1A2A2V5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SERTM1A2A2V5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SERTM1A2A2V5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERTM1A2A2V5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SERTM1A2A2V5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTM1A2A2V5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTM1A2A2V5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SERTM1A2A2V5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SERTM1A2A2V5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SERTM1A2A2V5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SERTM1A2A2V5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SERTM1A2A2V5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SERTM1A2A2V5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SERTM1A2A2V5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SERTM1A2A2V5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERTM1A2A2V5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERTM1A2A2V5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERTM1A2A2V5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERTM1A2A2V5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERTM1A2A2V5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERTM1A2A2V5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERTM1A2A2V5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms